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口腔溃疡是每个人一生中都会得的疾病，因为每个人的体质不同，所患的症状也会有所不同。
1.遗传因素如父母双方均患有复发性口腔溃疡时，其子女约有80—90%患病，若双亲之一患此病时，其子女约有50—60%患病。病理机制不明。
2.消化系统疾病及功能紊乱患系统性疾病的患者易发生口腔溃疡，主要是通过影响免疫系统而致病。口腔溃疡与胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肝炎等有关。研究表明：30%-48%的口腔溃疡患者有消化道疾病，如腹胀、腹泻或便秘等情况。其中9%以上有消化道溃疡。
3.精神因素有的患者在精神紧张、情绪波动、睡眠状况不佳的情况下发病，可能与植物神经功能失调有关。
4.内分泌变化有些女性每逢经期或行经前后就会出现口腔溃疡，用药治疗只能暂时缓解，下月行经时依然如故地出现，疼痛难忍，与此同时，还常伴有口干、心烦、易怒和大便干结等令人烦恼的症状。临床研究发现，月经期出现口腔溃疡主要是由于体内黄体酮水平增高而雌激素(孕酮等)的水平降低所致。
5.其他因素如缺乏微量元素锌、铁，缺乏叶酸、维生素B12以及营养不良等，可降低免疫功能，增加复发性口腔溃疡发病的可能性。
病毒可能是口腔溃疡的始动因子，但目前尚未在患者血清中查出相关抗体，亦未见从口腔溃疡病损组织中分离出病毒的报道。
细菌对口腔溃疡的作用已提出了多年，与口腔溃疡关系密切的细菌有血链球菌及幽门螺杆菌。
体内超氧自由基的生成和清除率不平衡、血栓素B2和6酮前列腺素比例失调及总体水平下降可引发口腔溃疡。
微循环障碍致血流速度慢，血液流量低，毛细血管静脉端管径扩张，造成局部缺血、缺氧从而引起黏膜膜损伤，溃疡形成。
血清中缺锌、缺铁、高铜等与口腔溃疡的发生有一定相关性。有报道称戒烟亦可诱发口腔溃疡。牙膏中的成分12-烷硫酸钠(SLS)可能刺激黏膜，诱发口腔溃疡。
6.不良的饮食及生活习惯嗜食辛辣刺激及肥腻食物，吸烟、酗酒，不注意口腔卫生等，会刺激口腔粘膜，造成粘膜的损伤，病菌乘此进入，即诱发溃疡的形成。
7.免疫功能缺陷：复发性口腔溃疡与免疫系统存在密切的关系，多为人体免疫功能缺陷引起的对摄入食物不耐受的变态反应。
8.食物不耐受如果口腔溃疡反复发作，持续数年甚至十几年未愈，非常有可能与食物不耐受有关。
食物不耐受指的是一种复杂的变态反应性疾病，人的免疫系统把进入人体内的某种或多种食物当成有害物质，从而针对这些物质产生过度的保护性免疫反应，YORK营养学实验室曾经做过一项研究，他们对个怀疑有食物不耐受的英国人进行了调查研究，有44%的人出现慢性腹泻、腹痛、溃疡、消化不良。
其中溃疡的最主要表现就是口腔溃疡。医院做食入物变应原筛查（俗称食物不耐受检测）。医院都可以做，目前做14项常规检测费用在-元之间。找到不耐受食物后，无需用药，只要调整饮食结构，忌食该食物，最快30天，最长半年就可完全摆脱口腔溃疡困扰。
9.维生素B族吸收有障碍人群中有一部分人天生有这个毛病（有遗传因素），这些人在正常的食物中无法获取足量的维生素B族（一种或多种），口服对应的维生素B效果也不明显。
这些人的症状有：
1、口腔溃疡
2、牙周炎牙龈萎缩
3、皮肤干燥甚至呈现鱼鳞状
4、顽固的脚气
5、饥饿时无法进行体内脂肪的“燃烧”（多吃一口就长胖少吃了不到时间就饿），等等。上述症状可能是一种也可能是两种以上同时存在。很多人吸烟后上述症状消失，戒烟后重新出现。
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